Да.
И кстати Wav намного лучше чем flac как формат. Поэтому я все свои рипы делаю сразу в WAV и именно в этом формате храню библиотеку записей на компе.

Разрубить flac альбома на отдельные дорожки может программа CUE-Splitter (кстати, она бесплатная). Не забудьте установить Monkey аудиоплагин если у вас на компе его еще нет.
А вот потом сконвертировать в WAV можно разными программами, но я пользуюсь встроенным конвертером программы для рипа - Easy CD-DA Extracor. Заодно там же могу все метаданные откоректировать.