SPDIF трансформаторно развязан всегда чётко: первичная обмотка-вторичная обмотка. Если RCA гнездо изолировано от корпуса(по другому и нельзя), то никаких общих земель.
А вот с AES иначе- практически везде земля сквозная: трансформаторно развязаны только горячий и холодный концы. Делать землю виртуальной(разрывать земляной провод) не выход, а вот правильный трансформатор