В DSD на тишине неидеальная склейка тоже заметна как тихий щелчок.
Можно проверить, что там с исходником, открыв исходный SACD образ в x64 версии плеера с включенной опцией "Full disc playback mode" в настройках SACD плагина (если эта опция при запуске была выключена, плеер надо перезапустить).
В этом случае модуль вывода будет воспроизводить непрерывную дорожку всего диска без поочередной загрузки отдельных треков. Если и в этом случае щелчок сохранится, то он точно первородный, в исходном материале.