Ну, скорее не пропустили, а не учли - фазовые сдвиги вносимые простым фильтром. Способы фильтрации обеспечивающие достаточное качество опорного сигнала и минимальные фазовые сдвиги – это отдельная тема (и довольно темная). Проще использовать генератор с ФАПЧ, по сути – это тоже фильтр, и тоже – со своими проблемами и недостатками.