Аплеер изменяет только одну системную настройку и это делается только при явном и, надеюсь, осознанном выборе пользователем этой опции - "Автомат системной частоты". В файле readme_ru.txt рассказано о возможных последствиях этого шага и о способе их устранения.
Также опционально может меняться период системного таймера, но это происходит только на время работы плеера.

---

(10-11-2016 13:44)Силантий писал(а):  Звука на центре нет, полез в настройки плеера, в одной из вкладок методом втыка переключил с 44,1 на Original, звук появился. Супер

Если верить картинке, то это переключение никакого эффекта иметь не могло сразу по двум причинам: 1) ресемплер остается выключенным, а этот выбор работает, только когда он включен 2) Сама измененная опция отключает ресемплирование частот дискретизации меньших 44.1KHz, а их и быть не могло в той ситуации.
То есть, звука не было, а потом появился по каким-то совсем иным причинам.