Ну, это из той же серии, что и "почему копии СD-дисков, побитно совпадающие с оригиналом, звучат немного иначе?"
Дело в том, что кроме цифровой части, существует еще и аналоговая, которая электрически так или иначе соединена с цифровой, ну хотя бы по источнику питания. Отсюда вытекают всевозможные взаимодействия (ну, например, на цифровой части возникает наводка, которая, не искажая "цифру", влияет на работу ЦАП со всеми вытекающими.... ) Наверное, в некоторых системах при декодировании оптического сигнала таких проблем возникает больше – разработчики сосредоточились на коаксиале и сэкономили на оптике.