Настройки в файлах aplayer.ini и plugin.ini.
Их можно скопировать из старой версии в новую.
Автоматически сохраненный плейлист в файле aplayer.dat
Модуль вывода в установочном архиве всегда стандартный. Если использовать EXTRAS, после обновления надо его снова выбрать в ap2config.exe.