"Ближе к концу" для CD значит "ближе к краю". Линейная скорость считывания при этом остаётся такой же - двигатель, который крутит CD, снижает обороты. Так что пыль - вряд-ли, чтение с краю и посередине происходит примерно в одинаковых условиях.
Можно предположить, что что-то не то с двигателем, который крутит CD. Например, выработался подшипник или стёрлась одна из пластин коллектора (если двиг коллекторный). И в том и в другом случае чтение тем хуже, чем ближе к краю.